Gerade in Marokko gelandet, erkrankt er an einer schweren, nicht näher genannten Krankheit, die ihn zur Ruhe zwingt; er kann daher nicht mehr predigen. Da er nicht gesund wird, ergibt er sich nach einiger Zeit dem Willen Gottes und kehrt heim. Das Schiff, auf dem er sich befindet, wird von einem Sturmwind erfasst und an die Küste von Sizilien getrieben, wo es Schiffbruch erleidet.
Von dort aus geht er nach ein paar Monaten der Konvaleszenz nach Assisi: Bei dieser Gelegenheit lernt er Franziskus kennen, der zu Pfingsten 1221 alle seine Brüder versammelt hatte.
Es ist eine einfache, aber sehr wichtige Begegnung für Antonius, die ihn in seiner Entscheidung bekräftigt, Gott als Mitglied der Franziskanischen Bruderschaft zu folgen.
Antonius wird eingeladen, sich in die Region Romagna zur Einsiedelei von Montepaolo, in der Nähe von Forlì, zu begeben. Dort lebt er ein zurückgezogenes Leben, er betet, meditiert und ist seinen Mitbrüdern zu Diensten.